fs.ts

// Copyright 2017 Istituto Nazionale di Fisica Nucleare
//
// Licensed under the EUPL

import * as assert from "assert";
import G = require("./globals");
import * as $ from "jquery";
import * as img from "./draw";

function generateTree(xmlDoc: Document)
{
  let tree: any = [];
  let first = true;
  let oldFolderParent: string = "";
  let oldFolder: string = "";

  //inizio leggendo tutti gli elementi da inserire nell'albero (caratterizzati
  //dall'avere un url di riferimento)
  let entry = $("D:href", xmlDoc);

  //per ogni elemento controllo se si tratta di una cartella o di un documento
  for (let i: number = 0; i < entry.length; i++) {
    let path: string[] = entry[i].childNodes[0].nodeValue.split("");

    //cartella, creo l'oggetto corrsipondente
    if (path[path.length - 1] == "/") {
      let folderName: string[] = entry[i].childNodes[0].nodeValue.split("/");
      let Folder = {
        text: folderName[folderName.length - 2],
        nodes: []
      }

      //posiziono la radice del file system, ne memorizzo il path e il padre
      if (first) {
        tree.push(Folder);
        first = false;
        oldFolder = entry[i].childNodes[0].nodeValue;
        oldFolderParent =
          oldFolder.slice(0, oldFolder.lastIndexOf(folderName[folderName.length - 2]));

        //per ogni cartella determino la relazione con la cartella precedente  
      } else {
        let newFolder: string = entry[i].childNodes[0].nodeValue;
        let newFolderParent: string =
          newFolder.slice(0, newFolder.lastIndexOf(folderName[folderName.length - 2]));

        //cartella sorella con quella memorizzata
        if (newFolderParent == oldFolderParent) {
          oldFolder = newFolder;
          insertOBJinFS(Folder, tree, folderName, 0);
          //cartella figlia di quella memorizzata 
        } else if (newFolderParent == oldFolder) {
          oldFolder = newFolder;
          oldFolderParent = newFolderParent;
          insertOBJinFS(Folder, tree, folderName, 0);
          //nessuno dei casi precedenti
        } else {
          //arretro nell'albero fino a trovare lo stesso padre. Per fare questo
          //tolgo al padre memorizzato in precedenza prima "/" poi il nome dell'
          //ultima cartella
          while (newFolderParent != oldFolderParent) {
            oldFolderParent = oldFolderParent.slice(0, oldFolderParent.length - 1);
            oldFolderParent = oldFolderParent.slice(0, (oldFolderParent.lastIndexOf("/") + 1));
          }
          oldFolder = newFolder;
          insertOBJinFS(Folder, tree, folderName, 0);
        }
      }

      //documento, creo l'oggetto corrispondente e lo inserisco nell'albero
    } else {
      let fileName: string[] = entry[i].childNodes[0].nodeValue.split("/");
      let filePath: string = entry[i].childNodes[0].nodeValue;
      let File = {
        text: fileName[fileName.length - 1],
        icon: "glyphicon glyphicon-file",
        selectedIcon: "glyphicon glyphicon-file",
        url: filePath
      }
      insertOBJinFS(File, tree, fileName, 1);
    }
  }

  return tree;
}

//funzione che posiziona l'oggetto passato in input nell'albero
function insertOBJinFS(objfs, tree, objfsName, type)
{
  //determino la profondità dell'oggetto (se è un file devo aggiungere 1 a causa di "/")
  let depth: number = objfsName.length;
  if (type) depth++;

  //in base alla profondità determino a quale oggetto agganciare quello in input
  let treePosition: any;
  let l: number = tree.length - 1;
  switch (depth) {
    case 6: treePosition = tree; break;
    case 7: treePosition = tree[l].nodes; break;
    case 8: treePosition =
      tree[l].nodes[tree[l].nodes.length - 1].nodes; break;
    case 9: treePosition =
      tree[l].nodes[tree[l].nodes.length - 1].nodes[tree[l].nodes[tree[l].nodes.length - 1].nodes.length - 1].nodes;
      break;
    case 10: treePosition =
      tree[l].nodes[tree[l].nodes.length - 1].nodes[tree[l].nodes[tree[l].nodes.length - 1].nodes.length - 1].nodes[tree[l].nodes[tree[l].nodes.length - 1].nodes[tree[l].nodes[tree[l].nodes.length - 1].nodes.length - 1].nodes.length - 1].nodes;
      break;
    default: break;
  }
  treePosition[treePosition.length - 1].nodes.push(objfs);
}

//funzione che dato l'url di un file, lo apre e lo legge passandone il contenuto
//alla funzione readData(). Questa funzione è invocata quando viene selezionato
//un file dall'albero
function openFileFromServer(url)
{
  let fileName: string[] = url.split("/");
  console.log("Try to open " + fileName[fileName.length - 1] + " ...");
  let txtFile: any = new XMLHttpRequest();
  txtFile.open("GET", url, true);
  txtFile.onreadystatechange = function ()
  {
    if (txtFile.readyState === 4) {
      if (txtFile.status === 200) {
        readImage((txtFile.responseText));
      }
    }
  }
  txtFile.send(null);
}

export function get_metadata(lines: string[]): G.Metadata
{
  let metadata = new G.Metadata();

  let xMin: number = 0, yMin: number = 0, xMax: number = 0, yMax: number = 0;
  let passo: number = 0; //dimensione di un pixel in micorn
  let readMode: string = 'u'; //direzione di lettura

  //scorro l'array soffermandomi solo sulle righe "intestazione delle x". Devo
  //determinare ascisse e cordinate minime e massime, il passo e la direzione di
  //scansione
  for (let i = 0; i < lines.length; i++) {
    if (parseInt(lines[i]) > 17000 && lines[i][0] == '5') {
      if (xMin == 0) { //se sono alla prima intestazione salvo la x e la y
        xMin = parseInt(lines[i]);
        yMin = parseInt(lines[i + 1]);
        i++;
      } else { //definisco passo e direzione di scansione dalla seconda intestazione
        if (parseInt(lines[i]) == xMin) {
          readMode = 'c';
          passo = Math.abs(yMin - +lines[i + 1]); // the unary + converts to number
          //se sto leggendo per colonne determino xMax leggendo dalla fine
          for (let j: number = lines.length; j > i; j--) {
            //se la riga è "intestazione x" memorizzo xMax e lo confronto con xMin
            if (parseInt(lines[j]) > 17000 && lines[j][0] == '5') {
              xMax = parseInt(lines[j]);
              if (xMax < xMin) { let t: number = xMax; xMax = xMin; xMin = t; }
              break;
            }
          }
        } else {
          readMode = 'r';
          passo = Math.abs(xMin - +lines[i]); // the unary + converts to number
          //se sto leggendo per righe determino yMax leggendo dalla fine
          for (let j: number = lines.length; j > i; j--) {
            //se la riga è "intestazione y" memorizzo yMax e lo confronto con yMin
            if (parseInt(lines[j]) > 17000 && lines[j][0] == '6') {
              yMax = parseInt(lines[j]);
              if (yMax < yMin) { let t: number = yMax; yMax = yMin; yMin = t; }
              break;
            }
          }
        }
        break;
      }
    }
  } //alert(xMin + " " + xMax + " " + yMin + " " + yMax + " " + passo);

  metadata = {xMin, xMax, yMin, yMax, stepSize: passo, direction: readMode};

  return metadata;
}

// version working on an array of numbers, obtained from the array of string lines
export function get_metadata_num(lines: number[]): G.Metadata
{
  let metadata = new G.Metadata();

  let xMin: number = 0, yMin: number = 0, xMax: number = 0, yMax: number = 0;
  let passo: number = 0; //dimensione di un pixel in micorn
  let readMode: string = 'u'; //direzione di lettura

  //scorro l'array soffermandomi solo sulle righe "intestazione delle x". Devo
  //determinare ascisse e cordinate minime e massime, il passo e la direzione di
  //scansione
  for (let i = 0; i < lines.length; i++) {
    let p = lines[i];
    if (lines[i] > 17000 && lines[i].toString()[0] == '5') {
      if (xMin == 0) { //se sono alla prima intestazione salvo la x e la y
        xMin = lines[i];
        yMin = lines[i + 1];
        i++;
      } else { //definisco passo e direzione di scansione dalla seconda intestazione
        if (lines[i] == xMin) {
          readMode = 'c';
          passo = Math.abs(yMin - lines[i + 1]); // the unary + converts to number
          //se sto leggendo per colonne determino xMax leggendo dalla fine
          for (let j: number = lines.length; j > i; j--) {
            //se la riga è "intestazione x" memorizzo xMax e lo confronto con xMin
            if (lines[j] > 17000 && lines[j].toString()[0] == '5') {
              xMax = lines[j];
              if (xMax < xMin) { let t: number = xMax; xMax = xMin; xMin = t; }
              break;
            }
          }
        } else {
          readMode = 'r';
          passo = Math.abs(xMin - lines[i]); // the unary + converts to number
          //se sto leggendo per righe determino yMax leggendo dalla fine
          for (let j: number = lines.length; j > i; j--) {
            //se la riga è "intestazione y" memorizzo yMax e lo confronto con yMin
            if (lines[j] > 17000 && lines[j].toString()[0] == '6') {
              yMax = lines[j];
              if (yMax < yMin) { let t: number = yMax; yMax = yMin; yMin = t; }
              break;
            }
          }
        }
        break;
      }
    }
  } //alert(xMin + " " + xMax + " " + yMin + " " + yMax + " " + passo);

  metadata = {xMin, xMax, yMin, yMax, stepSize: passo, direction: readMode};

  return metadata;
}

/* let metadata = get_metadata(lines);
let passo = metadata.stepSize; //dimensione di un pixel in micorn
let readMode = metadata.direction; //direzione di lettura
//coordinate minime e massime in entrambe le dimensioni
let xMin = metadata.xMin;
let yMin = metadata.yMin;
let xMax = metadata.xMax;
let yMax = metadata.yMax;
 */

// La funzione readImage() prende in ingresso il file di input memorizzato nella 
// stringa "fileString". La funzione riempie la matrice "DataMatrix" con i dati
// in modo che essi siano memorizzati in un formato più leggibile. Sono ricavate
// anche altre variabili necessarie per il resto del codice.
export function readImage(content: string): G.Image
{
  let newOrigin = { xp: 0, yp: 0 };  //origine nel caso di zoom
  let passo: number = 0; //dimensione di un pixel in micorn
  let readMode: string = 'u'; //direzione di lettura
  //coordinate minime e massime in entrambe le dimensioni
  let xMin: number = 0, yMin: number = 0, xMax: number = 0, yMax: number = 0;
  //array con il contenuto del file di input suddiviso per righe
  let fileStringArray: any = content.split("\n");

  //scorro l'array soffermandomi solo sulle righe "intestazione delle x". Devo
  //determinare ascisse e cordinate minime e massime, il passo e la direzione di
  //scansione
  for (let i: number = 0; i < fileStringArray.length; i++) {
    if (parseInt(fileStringArray[i]) > 17000 && fileStringArray[i][0] == '5') {
      if (xMin == 0) { //se sono alla prima intestazione salvo la x e la y
        xMin = parseInt(fileStringArray[i]);
        yMin = parseInt(fileStringArray[i + 1]);
        i++;
      } else { //definisco passo e direzione di scansione dalla seconda intestazione
        if (parseInt(fileStringArray[i]) == xMin) {
          readMode = 'c';
          passo = Math.abs(yMin - fileStringArray[i + 1]);
          //se sto leggendo per colonne determino xMax leggendo dalla fine
          for (let j: number = fileStringArray.length; j > i; j--) {
            //se la riga è "intestazione x" memorizzo xMax e lo confronto con xMin
            if (parseInt(fileStringArray[j]) > 17000 && fileStringArray[j][0] == '5') {
              xMax = parseInt(fileStringArray[j]);
              if (xMax < xMin) { let t: number = xMax; xMax = xMin; xMin = t; }
              break;
            }
          }
        } else {
          readMode = 'r';
          passo = Math.abs(xMin - fileStringArray[i]);
          //se sto leggendo per righe determino yMax leggendo dalla fine
          for (let j: number = fileStringArray.length; j > i; j--) {
            //se la riga è "intestazione y" memorizzo yMax e lo confronto con yMin
            if (parseInt(fileStringArray[j]) > 17000 && fileStringArray[j][0] == '6') {
              yMax = parseInt(fileStringArray[j]);
              if (yMax < yMin) { let t: number = yMax; yMax = yMin; yMin = t; }
              break;
            }
          }
        }
        break;
      }
    }
  } //alert(xMin + " " + xMax + " " + yMin + " " + yMax + " " + passo);

  assert.notEqual(readMode, 'u');

  //A seconda della direzione di lettura determino o yMin e yMax, o xMin e xMax    
  for (let i: number = 2; i < fileStringArray.length; i++) {
    if (readMode == 'c') { //se leggo per colonne devo deterinare yMin e yMax
      //mi soffermo sulle righe "intestazione y"
      if (parseInt(fileStringArray[i]) > 17000 && fileStringArray[i][0] == '6') {
        if (yMin > parseInt(fileStringArray[i])) {
          yMin = parseInt(fileStringArray[i]);
        }
        if (yMax < parseInt(fileStringArray[i])) {
          yMax = parseInt(fileStringArray[i]);
        }
      }
      //alla terza colonna posso uscire perché ho già tutte le informazioni
      if (parseInt(fileStringArray[i]) == xMin + (passo * 2)) { break; }
    } else { //se leggo per righe devo deterinare xMin e xMax 
      //mi soffermo sulle righe "intestazione x"
      if (parseInt(fileStringArray[i]) > 17000 && fileStringArray[i][0] == '5') {
        if (xMin > parseInt(fileStringArray[i])) {
          xMin = parseInt(fileStringArray[i]);
        }
        if (xMax < parseInt(fileStringArray[i])) {
          xMax = parseInt(fileStringArray[i]);
        }
      }
      //alla terza colonna posso uscire perché ho già tutte le informazioni
      if (parseInt(fileStringArray[i]) == yMin + 2000) { break; }
    }
  } //alert(xMin + " " + xMax + " " + yMin + " " + yMax + " " + passo);

  //Risolvo gli shift
  for (let i: number = 0; i < fileStringArray.length; i++) {
    //se leggo per colonne allora aggiungo 1 alle y di tutte le colonne dispari
    if (readMode == 'c' && parseInt(fileStringArray[i]) > 17000 &&
      fileStringArray[i][0] == '5' && (parseInt(fileStringArray[i]) / 1000) % 2 != 0) {

      fileStringArray[i + 1] = (parseInt(fileStringArray[i + 1]) + passo).toString();
    }
    //se leggo per righe allora aggiungo 1 alle x di tutte le righe dispari
    else if (readMode == 'r' && parseInt(fileStringArray[i]) > 17000 &&
      fileStringArray[i][0] == '5' && (parseInt(fileStringArray[i + 1]) / 1000) % 2 != 0) {

      fileStringArray[i] = (parseInt(fileStringArray[i]) + passo).toString();
    }
  }
  
  //Definisco le dimensioni della matrice DataMatrix e la inizializzo
  let xDim: number;
  let yDim: number;
  if (readMode == 'c') {
    xDim = (xMax - xMin) / passo + 1;
    yDim = (yMax - yMin) / passo - 2;
  } else {
    xDim = (xMax - xMin) / passo - 2;
    yDim = (yMax - yMin) / passo + 1;
  }
  let image = new G.Image();
  image.width = xDim;
  image.height = yDim;
  image.DataMatrix = new Array(xDim);
  for (let i: number = 0; i < xDim; i++) {
    image.DataMatrix[i] = new Array(yDim);
    for (let j: number = 0; j < yDim; j++) {
      image.DataMatrix[i][j] = new Array(G.Image.depth);
      for (let k: number = 0; k < G.Image.depth; k++) {
        image.DataMatrix[i][j][k] = 0;
      }
    }
  }

  //riempio la matrice DataMatrix eliminando i bordi
  for (let i: number = 0; i < fileStringArray.length; i++) {
    let x: number, y: number;
    var write: boolean;
    //riga "intestazione x": memorizzo le x e le y del punto e avanzo al conteggio
    if (parseInt(fileStringArray[i]) > 17000 && fileStringArray[i][0] == '5') {
      x = (parseInt(fileStringArray[i]) - xMin);
      y = (parseInt(fileStringArray[i + 1]) - yMin);
      if (x != 0) { x /= passo; }
      if (y != 0) { y /= passo; }
      i++;

      //non è un pixel del bordo e sto leggendo per colonne: i successivi valori
      //sono da considerare
      if (readMode == 'c' && y != 0 && y != 1 && y != (yMax - yMin) / passo &&
        y != (yMax - yMin) / passo + 1) {
        write = true;
        y -= 2; //aggiorno la y con i bordi tagliati
      }
      //non è un pixel del bordo e sto leggendo per righe: i successivi valori
      //sono da considerare
      else if (readMode == 'r' && x != 0 && x != 1 && x != (xMax - xMin) / passo &&
        x != (xMax - xMin) / passo + 1) {
        write = true;
        x -= 2; //aggiorno la x con i bordi tagliati
      }
      //pixel del bordo: i valori successivi sono da ignorare
      else { write = false; }

      //conteggio da considerare (non del bordo) 
    } else if (parseInt(fileStringArray[i]) < 17000 && write == true) {
      image.DataMatrix[xDim - x - 1][yDim - y - 1][parseInt(fileStringArray[i])] += 1;
    }
  }

  G.nOfCounts = new Array(xDim);
  for (let i: number = 0; i < xDim; i++) {
    G.nOfCounts[i] = new Array(yDim);
    for (let j: number = 0; j < yDim; j++) {
      G.nOfCounts[i][j] = G.sumVect(image.DataMatrix[i][j], 0, image.DataMatrix[i][j].length);
    }
  }

  G.maxAbsolute = G.findMax(G.nOfCounts, { x: 0, y: 0 }, { x: xDim - 1, y: yDim - 1 });

  G.setDataForCompleteChart(image);

  console.log("File open with succes");
  $("#load-spinner").css("display", "none");

  return image;
}