fs.ts

// Copyright 2017 Istituto Nazionale di Fisica Nucleare
//
// Licensed under the EUPL

import * as assert from "assert";
import * as $ from "jquery";
import * as Help from "./helper";
import G = require("./globals");

export function generateTree(xmlDoc: Document) {
  let tree: any = [];
  let first = true;
  let oldFolderParent: string = "";
  let oldFolder: string = "";

  //inizio leggendo tutti gli elementi da inserire nell'albero (caratterizzati
  //dall'avere un url di riferimento)
  let entry = $("D:href", xmlDoc);

  //per ogni elemento controllo se si tratta di una cartella o di un documento
  for (let i: number = 0; i < entry.length; i++) {
    let path: string[] = entry[i].childNodes[0].nodeValue.split("");

    //cartella, creo l'oggetto corrsipondente
    if (path[path.length - 1] == "/") {
      let folderName: string[] = entry[i].childNodes[0].nodeValue.split("/");
      let Folder = { text: folderName[folderName.length - 2], nodes: [] };

      //posiziono la radice del file system, ne memorizzo il path e il padre
      if (first) {
        tree.push(Folder);
        first = false;
        oldFolder = entry[i].childNodes[0].nodeValue;
        oldFolderParent = oldFolder.slice(0, oldFolder.lastIndexOf(folderName[folderName.length - 2]));

        //per ogni cartella determino la relazione con la cartella precedente
      } else {
        let newFolder: string = entry[i].childNodes[0].nodeValue;
        let newFolderParent: string = newFolder.slice(0, newFolder.lastIndexOf(folderName[folderName.length - 2]));

        //cartella sorella con quella memorizzata
        if (newFolderParent == oldFolderParent) {
          oldFolder = newFolder;
          insertOBJinFS(Folder, tree, folderName, 0);
          //cartella figlia di quella memorizzata
        } else if (newFolderParent == oldFolder) {
          oldFolder = newFolder;
          oldFolderParent = newFolderParent;
          insertOBJinFS(Folder, tree, folderName, 0);
          //nessuno dei casi precedenti
        } else {
          //arretro nell'albero fino a trovare lo stesso padre. Per fare questo
          //tolgo al padre memorizzato in precedenza prima "/" poi il nome dell'
          //ultima cartella
          while (newFolderParent != oldFolderParent) {
            oldFolderParent = oldFolderParent.slice(0, oldFolderParent.length - 1);
            oldFolderParent = oldFolderParent.slice(0, oldFolderParent.lastIndexOf("/") + 1);
          }
          oldFolder = newFolder;
          insertOBJinFS(Folder, tree, folderName, 0);
        }
      }

      //documento, creo l'oggetto corrispondente e lo inserisco nell'albero
    } else {
      let fileName: string[] = entry[i].childNodes[0].nodeValue.split("/");
      let filePath: string = entry[i].childNodes[0].nodeValue;
      let File = {
        text: fileName[fileName.length - 1], icon: "glyphicon glyphicon-file", selectedIcon: "glyphicon glyphicon-file", url: filePath
      };
      insertOBJinFS(File, tree, fileName, 1);
    }
  }
  return tree;
}

//funzione che posiziona l'oggetto passato in input nell'albero
function insertOBJinFS(objfs, tree, objfsName, type) {
  //determino la profondità dell'oggetto (se è un file devo aggiungere 1 a causa di "/")
  let depth: number = objfsName.length;
  if (type) depth++;

  //in base alla profondità determino a quale oggetto agganciare quello in input
  let treePosition: any;
  let l: number = tree.length - 1;
  switch (depth) {
    case 6:
      treePosition = tree;
      break;
    case 7:
      treePosition = tree[l].nodes;
      break;
    case 8:
      treePosition = tree[l].nodes[tree[l].nodes.length - 1].nodes;
      break;
    case 9:
      treePosition = tree[l].nodes[tree[l].nodes.length - 1].nodes[tree[l].nodes[tree[l].nodes.length - 1].nodes.length - 1].nodes;
      break;
    case 10:
      treePosition = tree[l].nodes[tree[l].nodes.length - 1].nodes[tree[l].nodes[tree[l].nodes.length - 1].nodes.length - 1]
        .nodes[tree[l].nodes[tree[l].nodes.length - 1].nodes[tree[l].nodes[tree[l].nodes.length - 1].nodes.length - 1].nodes.length - 1].nodes;
      break;
    default:
      break;
  }
  treePosition[treePosition.length - 1].nodes.push(objfs);
}

//funzione che dato l'url di un file, lo apre e lo legge passandone il contenuto
//alla funzione readData(). Questa funzione è invocata quando viene selezionato
//un file dall'albero
export function openFileFromServer(url) {
  let fileName: string[] = url.split("/");
  console.log("Try to open " + fileName[fileName.length - 1] + " ...");
  let txtFile: any = new XMLHttpRequest();
  txtFile.open("GET", url, true);
  txtFile.onreadystatechange = function () {
    if (txtFile.readyState === 4) {
      if (txtFile.status === 200) {
        readImage(txtFile.responseText);
      }
    }
  };
  txtFile.send(null);
}

// version working on an array of numbers, obtained from the array of string lines
function get_metadata_num(lines: number[]): void {
  let metadata = G.Metadata.getInstance();
  let image = G.Image.getInstance();
  metadata.xMin = 0;
  metadata.yMin = 0;
  metadata.xMax = 0;
  metadata.yMax = 0;
  metadata.step = 0; //dimensione di un pixel in micorn
  metadata.direction = G.ReadDirection.u; //direzione di lettura

  //scorro l'array soffermandomi solo sulle righe "intestazione delle x". Devo
  //determinare ascisse e cordinate minime e massime, il passo e la direzione di
  //scansione
  for (let i = 0; i < lines.length; i++) {
    if (Help.isAnXHeader(lines[i], image)) {
      if (metadata.xMin == 0) {
        //se sono alla prima intestazione salvo la x e la y
        metadata.xMin = lines[i];
        metadata.yMin = lines[i + 1];
        i++;
      } else {
        //definisco passo e direzione di scansione dalla seconda intestazione
        if (lines[i] == metadata.xMin) {
          metadata.direction = G.ReadDirection.c;
          metadata.step = Math.abs(metadata.yMin - lines[i + 1]); // the unary + converts to number
          //se sto leggendo per colonne determino metadata.xMax leggendo dalla fine
          for (let j: number = lines.length; j > i; j--) {
            //se la riga è "intestazione x" memorizzo metadata.xMax e lo confronto con metadata.xMin
            if (Help.isAnXHeader(lines[j], image)) {
              metadata.xMax = lines[j];
              if (metadata.xMax < metadata.xMin) {
                let t: number = metadata.xMax;
                metadata.xMax = metadata.xMin;
                metadata.xMin = t;
              }
              break;
            }
          }
        } else {
          metadata.direction = G.ReadDirection.r;
          metadata.step = Math.abs(metadata.xMin - lines[i]); // the unary + converts to number
          //se sto leggendo per righe determino metadata.yMax leggendo dalla fine
          for (let j: number = lines.length; j > i; j--) {
            //se la riga è "intestazione y" memorizzo metadata.yMax e lo confronto con metadata.yMin
            if (Help.isAnYHeader(lines[j], image)) {
              metadata.yMax = lines[j];
              if (metadata.yMax < metadata.yMin) {
                let t: number = metadata.yMax;
                metadata.yMax = metadata.yMin;
                metadata.yMin = t;
              }
              break;
            }
          }
        }
        break;
      }
    }
  }
  //A seconda della direzione di lettura determino o metadata.yMin e metadata.yMax, o metadata.xMin e metadata.xMax
  for (let i: number = 2; i < lines.length; i++) {
    if (metadata.direction == G.ReadDirection.c) {
      //se leggo per colonne devo deterinare metadata.yMin e metadata.yMax
      //mi soffermo sulle righe "intestazione y"
      if (Help.isAnYHeader(lines[i], image)) {
        if (metadata.yMin > lines[i]) {
          metadata.yMin = lines[i];
        }
        if (metadata.yMax < lines[i]) {
          metadata.yMax = lines[i];
        }
      }
      //alla terza colonna posso uscire perché ho già tutte le informazioni
      if (lines[i] == metadata.xMin + metadata.step * 2) {
        break;
      }
    } else {
      //se leggo per righe devo deterinare metadata.xMin e metadata.xMax
      //mi soffermo sulle righe "intestazione x"
      if (Help.isAnXHeader(lines[i], image)) {
        if (metadata.xMin > lines[i]) {
          metadata.xMin = lines[i];
        }
        if (metadata.xMax < lines[i]) {
          metadata.xMax = lines[i];
        }
      }
      //alla terza colonna posso uscire perché ho già tutte le informazioni
      if (lines[i] == metadata.yMin + 2000) {
        break;
      }
    }
  }
}

export function get_metadata(lines: number[]): void {
  try {
    get_metadata_num(lines);
  }
  catch (e) {
    throw new Error(e);
  }
}

// La funzione readImage() prende in ingresso il file di input memorizzato nella
// stringa "fileString". La funzione riempie la matrice "DataMatrix" con i dati
// in modo che essi siano memorizzati in un formato più leggibile. Sono ricavate
// anche altre variabili necessarie per il resto del codice.

export function readImage(content: string): G.Image {
  let lines = content.split("\n").map(Number);
  let metadata = G.Metadata.getInstance();

  get_metadata(lines);
  console.log("lines");
  //console.log(lines);

  let image = G.Image.getInstance();

  // Risolvo gli shift
  for (let i = 0; i < lines.length; i++) {
    if (Help.isAnXHeader(lines[i], image)) {
      // this is an x-coordinate
      if (metadata.direction == G.ReadDirection.c && (lines[i] / 1000) % 2 != 0) {
        // increment the y-coordinate of odd columns
        lines[i + 1] += metadata.step;
      } else if (metadata.direction == G.ReadDirection.r && (lines[i + 1] / 1000) % 2 != 0) {
        // increment the x-coordinate of even rows
        lines[i] += metadata.step;
      }
    }
  }

  //Definisco le dimensioni della matrice DataMatrix e la inizializzo
  let xDim: number;
  let yDim: number;
  if (metadata.direction == G.ReadDirection.c) {
    xDim = (metadata.xMax - metadata.xMin) / metadata.step + 1;
    yDim = (metadata.yMax - metadata.yMin) / metadata.step - 2;
  } else {
    xDim = (metadata.xMax - metadata.xMin) / metadata.step - 2;
    yDim = (metadata.yMax - metadata.yMin) / metadata.step + 1;
  }

  image.width = xDim;
  image.height = yDim;
  image.DataMatrix = new Array(xDim);

  for (let i: number = 0; i < xDim; i++) {
    image.DataMatrix[i] = new Array(yDim);
    for (let j: number = 0; j < yDim; j++) {
      image.DataMatrix[i][j] = new Array(G.Image.getInstance().depth);
      for (let k: number = 0; k < G.Image.getInstance().depth; k++) {
        image.DataMatrix[i][j][k] = 0;
      }
    }
  }

  //riempio la matrice DataMatrix eliminando i bordi
  let x: number, y: number;
  let write: boolean;
  for (let i = 0; i < lines.length; i++) {
    //riga "intestazione x": memorizzo le x e le y del punto e avanzo al conteggio
    if (Help.isAnXHeader(lines[i], image)) {
      x = lines[i] - metadata.xMin;
      y = lines[i + 1] - metadata.yMin;
      if (x != 0) {
        x /= metadata.step;
      }
      if (y != 0) {
        y /= metadata.step;
      }
      i++;

      //non è un pixel del bordo e sto leggendo per colonne: i successivi valori
      //sono da considerare
      if (metadata.direction == G.ReadDirection.c && y != 0 && y != 1 && y != (metadata.yMax - metadata.yMin) / metadata.step &&
        y != (metadata.yMax - metadata.yMin) / metadata.step + 1) {
        write = true;
        y -= 2; //aggiorno la y con i bordi tagliati
      } else if (
        metadata.direction == G.ReadDirection.r && x != 0 && x != 1 && x != (metadata.xMax - metadata.xMin) / metadata.step &&
        x != (metadata.xMax - metadata.xMin) / metadata.step + 1) {
        //non è un pixel del bordo e sto leggendo per righe: i successivi valori
        //sono da considerare
        write = true;
        x -= 2; //aggiorno la x con i bordi tagliati
      } else {
        //pixel del bordo: i valori successivi sono da ignorare
        write = false;
      }

      //conteggio da considerare (non del bordo)
    } else if (lines[i] < image.headerSetValue && write == true) {
      image.DataMatrix[xDim - x - 1][yDim - y - 1][lines[i]] += 1;
    }
  }
  //console.log(image.DataMatrix);
  image.nOfCounts = new Array(xDim);
  for (let i: number = 0; i < xDim; i++) {
    image.nOfCounts[i] = new Array(yDim);
    for (let j: number = 0; j < yDim; j++) {
      image.nOfCounts[i][j] = Help.sumVect(image.DataMatrix[i][j], 0, image.DataMatrix[i][j].length);
    }
  }
  //console.log(image.nOfCounts);

  image.maxAbsolute = Help.findMax(image.nOfCounts, { x: 0, y: 0 }, { x: xDim - 1, y: yDim - 1 });

  Help.setDataForCompleteChart(image, G.Chart.getInstance());
  return image;
}